Kommissionens genomförandeförordning (EU) 2025/179 av den 31 januari 2025 om insamling och översändande av molekylära analysdata inom ramen för epidemiologiska utredningar av livsmedelsburna utbrott i enlighet med Europaparlamentets och rådets direktiv 2003/99/EG

(1)

Enligt artikel 8.2 i direktiv 2003/99/EG ska den behöriga myndigheten i respektive medlemsstat utreda livsmedelsburna utbrott i samarbete med de behöriga myndigheter som ansvarar för att hantera allvarliga gränsöverskridande hot mot människors hälsa och konsekvenserna av dessa i enlighet med Europaparlamentets och rådets beslut nr 2119/98/EG (2). Det beslutet upphävdes genom Europaparlamentets och rådets beslut 1082/2013/EU (3), som i sin tur upphävdes genom och ersattes av Europaparlamentets och rådets förordning (EU) 2022/2371 (4). Utredningarna ska få fram uppgifter om utbrottets epidemiologiska profil, vilka livsmedel som kan vara berörda, tänkbara orsaker till utbrotten samt relevanta epidemiologiska och mikrobiologiska undersökningar.

(2)

Ett effektivt och sektorsövergripande samarbete mellan myndigheterna för folkhälsa och livsmedelssäkerhet vid sådana utredningar är avgörande för att begränsa effekterna på folkhälsan vid ett utbrott och minimera de ekonomiska konsekvenserna av återkallelser och tillbakadragande av livsmedel som inte är säkra eller som eventuellt inte är säkra. Därför är det nödvändigt att man snabbt och tillförlitligt identifierar satser och partier eller sändningar som innehåller kontaminerade livsmedel samt orsaken till utbrottet.

(3)

Helgenomsekvensering är en modern molekylär analysteknik för mikrobiologiska undersökningar som i hög grad underlättar en snabb identifiering av kluster av mikroorganismer och stöder de epidemiologiska undersökningarna. Den gör det möjligt att under utredningen av ett utbrott fastställa kopplingar mellan isolat av livsmedelsburna patogener som erhållits från människor, livsmedel, djur, foder och den omgivande miljön.

(4)

För att avsevärt underlätta utredningar av livsmedelsburna utbrott och snabbt upptäcka källorna till dessa utbrott bör medlemsstaterna vara skyldiga att från prover från livsmedel, djur, foder och den omgivande miljön samla in isolat av Salmonella enterica, Listeria monocytogenes, Escherichia coli, Campylobacter jejuni och Campylobacter coli från livsmedels- och foderföretagare och vid offentlig kontroll, om dessa isolat är förknippade med eller misstänks vara förknippade med ett livsmedelsburet utbrott. Medlemsstaterna bör också vara skyldiga att sekvensera hela genomet hos dessa isolat.

(5)

Medlemsstaterna bör översända resultaten av helgenomsekvenseringen av isolat av dessa patogener från livsmedel, djur, foder och den omgivande miljön till Europeiska myndigheten för livsmedelssäkerhet (livsmedelsmyndigheten), som tillsammans med Europeiska centrumet för förebyggande och kontroll av sjukdomar (ECDC) har utvecklat ett gemensamt One health-system. I det gemensamma One health-systemet kan livsmedelsmyndigheten jämföra resultaten av helgenomsekvenseringen av de isolat av dessa patogener som samlats in i enlighet med den här förordningen med de resultat av helgenomsekvenseringen av humana isolat som lämnats till ECDC i enlighet med artikel 13.3 d i förordning (EU) 2022/2371. En sådan jämförelse gör det möjligt att identifiera utbrottskällan och de berörda sändningarna när den används i kombination med data från epidemiologiska utredningar. När resultaten av helgenomsekvenseringen översänds till livsmedelsmyndigheten bör kompletterande data, som är väsentliga för utredningen av livsmedelsburna utbrott, inkluderas.

(6)

Medlemsstaterna och livsmedelsmyndigheten bör ges tillräckligt med tid för att anpassa sig till de nya kraven på insamling av isolat som härrör från prover från livsmedel, djur, foder och den omgivande miljön, på helgenomsekvensering av dessa isolat och på översändande av kompletterande data, samt för att tillhandahålla nödvändiga tekniska tillämpningar och finansiella medel. Kraven i denna förordning bör därför börja tillämpas 18 månader efter den dag då denna förordning träder i kraft.

(7)

De åtgärder som föreskrivs i den här förordningen är förenliga med yttrandet från ständiga kommittén för växter, djur, livsmedel och foder.